Общественная организация «Ассоциация музеев космонавтики» (АМКОС) была образована 23 ноября 1989 г. Большую помощь в становлении Ассоциации оказала Федерация космонавтики СССР и лично ее председатель Н. Н. Рукавишников.
На учредительную конференцию АМКОС (СССР) съехались делегаты из 163 городов страны.
Президентом Ассоциации был избран летчик-космонавт СССР, дважды Герой Советского Союза Попович Павел Романович. Вице-президентом организации была избрана Кирдода Нина Семеновна.
АМКОС была первой в стране профильной Ассоциацией, объединившей общественные и ведомственные музеи космонавтики, ведущие музеи других профилей, имеющих экспозицию по космонавтике, школьные музеи космонавтики, планетарии большинства республик Советского Союза.
В 1992 г. Ассоциация прошла перерегистрацию и стала Общероссийской общественной организацией. В том же 1992 г. по ходатайству Ассоциации Государственный музей истории космонавтики им. Циолковского в Калуге (ГМИК) был признан головным методическим центром всех музеев космонавтики страны.
С 2000 г. на Академических чтениях по космонавтике (Королевских чтениях) существует секция «Космонавтика и Культура», которую курирует АМКОС.
В январе 2010 г. в связи со скоропостижной смертью президента АМКОС П. Р. Поповича, была проведена Чрезвычайная конференция, посвященная 20-летию создания Ассоциации, на которой новым президентом АМКОС был избран летчик-космонавт СССР, дважды Герой Советского Союза Джанибеков Владимир Александрович.
За время своей 30-летней деятельности Ассоциация помогла состояться, встать на ноги десяткам музеев. Совместными усилиями музеев были организованы масштабные космические выставки, в том числе международные, Ассоциация помогала пополнению музейных фондов, проводила межмузейные семинары и научно-практические конференции, участвовала в международных космических фестивалях, издавала различные пособия, сборники, разрабатывала рекомендации по космическому туризму. В частности, Ассоциацией выпущен первый в стране альбом-справочник «По России космической». И мн. мн. другое.
На сегодняшний день АМКОС объединяет более 80-ти отделений в 48 регионах России. Кроме музеев в Ассоциацию входят планетарии, дворцы детского технического творчества, кружки ракетомоделизма и др. общественные космические инициативы.